你或許會很難想象,有一天,人類能夠像裝配零件一樣,將自己設(shè)計出的細胞、微生物,組裝成一個協(xié)調(diào)運轉(zhuǎn)的新整體,進而控制其完成任務(wù)。不過,這樣充滿未來感的故事,其實正在當下發(fā)生,并形成了一門生物科學(xué)分支學(xué)科——合成生物學(xué)。不久前,美國波士頓海恩斯
你或許會很難想象,
有一天,
人類能夠像裝配零件一樣,
將自己設(shè)計出的細胞、微生物,
組裝成一個協(xié)調(diào)運轉(zhuǎn)的新整體,
進而控制其完成任務(wù)。
不過,這樣充滿未來感的故事,
其實正在當下發(fā)生,
并形成了一門生物科學(xué)分支學(xué)科——
合成生物學(xué)。
不久前,美國波士頓海恩斯國際會議中心,浙江大學(xué)代表隊ZJU-China在浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陳銘教授的帶領(lǐng)下,以項目家用HPV檢測儀“PaDetector”斬獲國際基因工程機器大賽(iGEM)金牌。這也是自2010年參賽以來,浙大代表隊收獲的第七枚金牌。

ZJU-China團隊與國際基因工程機器大賽評委合影
ZJU-China團隊與國際基因工程機器大賽評委合影
近二十年來,中國的宮頸癌發(fā)病率持續(xù)上升??墒怯捎诜N種原因,HPV(人類乳頭瘤病毒)檢測作為宮頸癌有效預(yù)防措施之一,卻在普及過程中屢次碰壁。這一方面不利于女性的身心健康,另一方面也加重了醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)的負擔(dān)。
因此,在陳銘教授的指導(dǎo)下,ZJU-China團隊經(jīng)過幾輪選題,綜合比較可操作性與現(xiàn)實意義等因素后,將目光聚焦了在“方便簡潔的HPV自檢方法”上。
設(shè)計初期,團隊的設(shè)想是,通過添加精細裝置,在衛(wèi)生巾內(nèi)“一步到位”地完成檢測過程,直接將結(jié)果通過顏色可視化。但在衛(wèi)生巾制作流程的實地考察中,隊員們與制作廠商交流后發(fā)現(xiàn),這種方法的成本太高,只好將檢測設(shè)備單獨分離。
他們以女性經(jīng)血作為樣本,結(jié)合兩種常溫檢測方法,在設(shè)計、制造、改進3個版本后,最終呈現(xiàn)出了用于HPV早期篩查的家用HPV檢測儀“PaDetector”。
“PaDetector”的原理基于針對性強、靈敏度高的CRISPR/Cas12a系統(tǒng)。實驗過程中,操作者首先需要破裂宮頸上皮細胞樣品,用RPA擴增獲得HPV基因組,然后通過Cas12a蛋白的核酸酶活性指示進行檢測,并使用紫外手電照射反應(yīng)液,以觀察結(jié)果。
為進一步提高“PaDetector”的高通性,實現(xiàn)在一次反應(yīng)中同時檢測多種HPV亞型,團隊之后還設(shè)計了另一種利用核酸雜交鏈進一步放大信號的方法。
而在實際的日常應(yīng)用中,用戶其實只需要取下衛(wèi)生巾夾層內(nèi)的裝置,將收集的經(jīng)血樣本放入“PaDetector”,靜置40分鐘至1小時,就可以看到檢測結(jié)果,非常符合團隊當時提出的“簡便”原則。
分工明確,通力合作,準備充分的他們終勝出
本次參賽隊伍ZJU-China由浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、醫(yī)學(xué)院、竺可楨學(xué)院、農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院、計算機科學(xué)與技術(shù)學(xué)院和控制科學(xué)與工程學(xué)院共6個院系的12名本科生組成。
團隊大致被分為“濕隊”和“干隊”兩支隊伍。“干隊”負責(zé)軟件部分,“濕隊”負責(zé)實驗部分。隊長蘇鍵解釋了兩支隊伍的劃分依據(jù):“由于實驗通常需要接觸溶液、培養(yǎng)基這些潮濕的東西,所以實驗隊被稱為‘濕隊’,相應(yīng)地,軟件隊就被稱為‘干隊’。這也是比較通用的劃分方法?!?/p>
工程浩大、細節(jié)繁瑣,團隊內(nèi)部經(jīng)常會產(chǎn)生分歧,但好在隊員們都有著同一個目標,始終能夠?qū)⒉煌庖姺诺脚_前探討,在愈辯愈明中,找出合適的答案。
ZJU-China團隊的實驗室,白板上寫著:
-If we knew what we were doing,
it wouldn't be called research, would it?
-Absolutely Right.
與理念分歧相比,實際操作更顯得狀況百出,幾乎每位隊員都遇到過意料之外的情況。
對于“濕隊”隊員們來說,實驗結(jié)果是他們掛在心頭的重中之重。
2019年的暑假期間,因為自行設(shè)計的方法始終無法分辨HPV16和HPV18兩種病毒,隊員蘇鍵“幾乎做了一整個假期的實驗”。他在百思不得其解中郁悶抓狂,最后卻還是決定冷靜下來,耐心地一項項排除可疑因素。
直到借用另一種實驗方法后,蘇鍵才找到了令他啼笑皆非的錯因——他在實驗中混淆了病毒載體。解決完這個頗有些“烏龍”意味的問題,隨后的實驗進展十分迅速,蘇鍵終于順利地得到了預(yù)期結(jié)果,“松了一口氣”。
隨后的十一假期,隊員李文曉本想將這段時間專門留給“PaDetector”,卻忘記了生物公司放假,不能向她及時寄送實驗所需材料。這讓她暗自懊悔“錯過了多好的時間”,只能在假期結(jié)束后,課堂實驗室兩頭跑,更加高效地進行實驗。實驗成功后,她甚至為了慶祝,將微信頭像直接換成了實驗結(jié)果。
隨著截止時間的推近,團隊的安排愈發(fā)緊鑼密鼓,隊員之間也漸漸模糊了一開始劃分的界限,每個人都要身兼數(shù)職。李鴻屹主要負責(zé)數(shù)學(xué)建模工作,但為呈現(xiàn)出最好的視覺效果,他同樣參與了網(wǎng)頁的后期修改工作,以保證“PaDetector”項目網(wǎng)站的內(nèi)容質(zhì)量和展現(xiàn)形式。
除此之外,ZJU-China的隊員們還前往低碳科技館,借助主題卡片,向小朋友們科普了HPV知識,希望借此提高其健康意識;更和兩支中國區(qū)高中隊伍共同主辦了“高中版國際基因工程機器大賽”,邀請大賽官方人員出席,指導(dǎo)高中生實驗室安全規(guī)范、項目原理,得到了參與者們的一致認可。
正是因為保持著齊心協(xié)力的狀態(tài),扎扎實實地完成了繁雜艱巨的前期任務(wù),踏上大洋彼岸的決賽場地后,隊員們并沒有感受到特別緊張的氛圍,反倒純熟自如地將作品展現(xiàn)給了世界。
最終,國際基因工程機器大賽的評委們高度肯定了“PaDetector”,認為它是ZJU-China團隊對身邊問題提出的合成生物學(xué)解決方案,其中運用的兩種HPV檢測方法,能夠應(yīng)用于檢測病毒、癌癥、基因突變等不同場景,具有很高的泛用性和可升級性,并決定將金牌頒發(fā)給ZJU-China團隊。
這個獲得獎牌的喜悅時刻,成為隊員們的難忘瞬間。當然,有關(guān)國際基因工程機器大賽的別樣記憶里,必定也少不了他們在臺上的亮眼表現(xiàn)、與優(yōu)秀同齡人的精彩研討、賽后犒勞自己的波士頓大龍蝦……
但更被隊員們掛在嘴邊的,還有一幅丟失在遙遠回國路途的主題海報。它成為此次大賽之行,隊員們唯一的遺憾——“應(yīng)該把海報筒封好的”。
而對于該項目的發(fā)展前景,團隊指導(dǎo)老師陳銘教授指出,目前宮頸癌在中國的問題還比較嚴重,團隊在實現(xiàn)HPV的家用檢測上有了很好的探索。同時,陳銘老師鼓勵團隊的同學(xué)們將相關(guān)的經(jīng)驗拓展至當前對新冠肺炎檢測的探索中。當然,他也表示,該項目具有較好的發(fā)展前景,但真正應(yīng)用到臨床還需不斷完善,尚需時日。
國際基因工程機器大賽(iGEM)簡介
國際基因工程機器大賽(iGEM)是合成生物學(xué)領(lǐng)域的國際頂級大學(xué)生科技賽事,旨在推動合成生物學(xué)的發(fā)展,促進各國大學(xué)生在該領(lǐng)域的學(xué)習(xí)、交流與合作。這項賽事由麻省理工學(xué)院于2003年創(chuàng)辦,初期主要面向在校本科生,后逐漸擴大到研究生以及高中生。
國際基因工程機器大賽尤其強調(diào)“Local people solving local problems”,號召參賽者深入自身環(huán)境解決問題,構(gòu)建并利用基因回路和數(shù)學(xué)模型,實現(xiàn)對人工生物系統(tǒng)的預(yù)測、操縱與測量,其趣味性和實際應(yīng)用性極富挑戰(zhàn)力和吸引力。
目前,大賽已有哈佛大學(xué)、劍橋大學(xué)等多所世界著名高校的年輕人報名參加,其賽況和研究成果也受到《科學(xué)》、《自然》、《科學(xué)美國人》、《經(jīng)濟學(xué)人》等頂級學(xué)術(shù)雜志的關(guān)注,幾乎每年都有相關(guān)專題報道。
文字記者:雷思涵
圖片由受訪者提供
本文編輯:浙江大學(xué)微訊社 陳晗鈺
責(zé)任編輯:周亦穎